Рис. 1. Структура белка
Рис. 2. Асимметрическая единица белка
Уридинфосфорилаза E. coli в комплексе с 5-фторуридином и сульфатом - это фермент, участвующий в метаболизме пиримидина. Относится к семейству гликозилтрансфераз, в частности пентозилтрансфераз. Состоит из двух цепей длиной 256 аминокислотных остатков, мутаций, согласно PDB, нет. Цепь B и цепь А идентичны. Вторичная структура белка представлена альфа-спиралями и бета-слоями.
Асимметрическая единица состоит из цепей А и В, биологическая единица представлена гексамером, состоящим из 3 асимметрических единиц, т.е. 3 цепей А и 3 цепей В.
Цепи А и В (т.к. идентичны): относятся к организму Escherichia coli (strain K12) P12758, Uridine phosphorylase, функция: катализирует обратимое фосфорилитическое расщепление уридина до урацила и рибозо-1-фосфата (PubMed: 16751). Проявляет слабую активность по отношению к дезоксиуридину и тимидину (PubMed: 16751). Полученные молекулы затем используются в качестве источников углерода и энергии или в качестве пиримидиновых оснований для синтеза нуклеотидов. Относительно референса из Uniprot в аминокислотной последовательности в начале последовательности присутствуют 3 дополнительные аминокислоты. Больше мутаций нет. Модифицированных аминокислотных остатков нет.
В данном белке присутствуют малые молекулы: 5-FLUOROURIDINE (5UD), SULFATE ION (SO4), POTASSIUM ION (K). Соответствующие строки из pdb-файла приведены в Гугл-документе.
