β-лактамаза бактерии Oceanobacillus iheyensis штамм HTE831

Описание белка β-лактамазы (beta-lactamase) из генома бактерии Oceanobacillus iheyensis штамм HTE831

Информация о белке и его гене, полученная из записи NC_004193 базы данных RefSeq с полным геномом бактерии приведена в таблице 1. На рисунке 1 изображена окрестность этого гена.

Таблица 1. Основные свойства гена, кодирующего β-лактамазу (идентификатор белка в базе данных NCBI: NP_693715.1) из организма Oceanobacillus iheyensis HTE83

Свойство	Квалификатор в записи генома	Значение
Локус гена в геноме	/locus_tag	OB2793
Имя гена	/gene	-
Идентификатор гена в базе данных NCBI Gene	/db_xref="GeneID:	1016972
Начало в геноме	-	2871462
Конец в геноме	-	2872376
Цепь	-	Обратная
Длина гена (в парах нуклеотидов)	-	915
Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein	/protein_id	NP_693715.1
Длина белка (в аминокислотных остатках)	-	304

Рис.1. окрестность гена белка β-лактамазы из генома бактерии Oceanobacillus iheyensis штамм HTE831. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI

Из рисунка 1 следует, что соседние гены сонаправлены с геном β-лактамазы. Расстояние между данным геном и геном с 5’-конца равно 97 пар нуклеотидов, между геном и геном с 3’-конца – 139 пар нуклеотидов.