Краткое описание генома вируса American grass carp reovirus


American grass carp reovirus относится к семейству Reoviridae, роду Aquareovirus. Это сферические [1] вирусы, поражающие молодняк рыб. AGCRV был найден в мальках некоторых рыб, таких как белый амур и золотистый синец [2]. Аквареовирусы вызывают обильное кровотечение, которое в большинстве случаев приводит к гибели мальков [2]. На картинке справа приведено сравнение AGCRV и GCRV.

Английское название вируса American grass carp reovirus
Русское название вируса Американский реовирус белого амура
Количество фрагментов в полном геноме 11
Общая длина генома 23576 нуклеотидов
Количество кодируемых в геноме полипептидов 12
Количество "зрелых" вирусных белков 0 

>YP_001837100.1
MPCQDTVSLSIQHTHVIIQNSCCTTVSTSASTSATAYGLGCLALGCAGIAAAGICICCLI 
HGCPACPRRLGVRKQSSLSKQGHVSFHHLNPSDRVSRPYHPSCPTDVDLYLGGVQHDPDY
VSHAQPIETQPQPLPPPPAYS

Источники:
[1] Википедия, Реовирусы.
[2] Virology, Volume 373, Issue 2, 10 April 2008, Pages 310–321.
© Матвеев Андрей, 2016 AD