Краткое описание генома бактерии Clostridium perfringens ATCC 13124
| ||||||||||||||||
| ||||||||||||||||
|
Clostridium perfringens — вид грамположительных, строго анаэробных (за исключением C. perfringens типа A) спорообразующих бактерий рода клостридий.
Морфология
Крупные (0,8—1,5 × 4—8 мкм) полиморфные палочковидные грамположительные бактерии. Споры овальные, расположены центрально либо субтерминально. Неподвижны, в организме человека образуют капсулу.
Культуральные свойства
Хемоорганогетеротроф, облигатный анаэроб. Растёт на простых питательных средах в анаэробных условиях. На агаризованных средах образуются круглые колонии 1—2 мм в диаметре с гладким или зубчатым краем. Сбраживает с активным газообразованием глюкозу, лактозу, мальтозу и сахарозу. Образует масляную кислоту в ходе ацетобутиратного брожения, способен восстанавливать нитраты.
Патогенность
C. perfringens является возбудителем пищевых токсикоинфекций человека и одним из возбудителей газовой гангрены. Синтезирует протеиназы , лецитиназу, коллагеназу, гиалуронидазу и другие ферменты агрессивности. Продуцирует также токсины. α-токсин является фосфолипазой С, обладающей гемолитическими свойствами, ε-токсин является белком, образует поры в мембранах эпителиоцитов кишечника человека и вызывает выход ионов K+ и воды из клетки [1].
Геном
Геном Clostridium perfringens ATCC 13124 представлен кольцевой молекулой ДНК.
Основные параметры генома представлены в таблице. Анализ файлов формата "ptt" позволяет
предположить, что наиболее типичными для данной бактерии являются белки длиной 200-300
аминокислот.
Встречаемость белков разных длин можно проследить на гистограмме, созданной
с помощью Python [2].