Краткое описание генома бактерии Clostridium perfringens ATCC 13124

Систематическое положение
Царство Бактерии
ТипFirmicutes
Класс Clostridia
Порядок Clostridiales
Семейство Clostridiaceae
Род Clostridium
Вид Clostridium perfringens ATCC 13124
Clostridium perfringens, окраска по методу Грама
Геном Clostridium perfringens ATCC 13124
Общая длина генома, (п. н.)3256683
Количество генов 2932
Соотношение пар азотистых оснований GC%:28.4
Количество кодируемых белков 2782
Дата секвенирования генома2006 год

Clostridium perfringens — вид грамположительных, строго анаэробных (за исключением C. perfringens типа A) спорообразующих бактерий рода клостридий.

Морфология

Крупные (0,8—1,5 × 4—8 мкм) полиморфные палочковидные грамположительные бактерии. Споры овальные, расположены центрально либо субтерминально. Неподвижны, в организме человека образуют капсулу.

Культуральные свойства

Хемоорганогетеротроф, облигатный анаэроб. Растёт на простых питательных средах в анаэробных условиях. На агаризованных средах образуются круглые колонии 1—2 мм в диаметре с гладким или зубчатым краем. Сбраживает с активным газообразованием глюкозу, лактозу, мальтозу и сахарозу. Образует масляную кислоту в ходе ацетобутиратного брожения, способен восстанавливать нитраты.

Патогенность

C. perfringens является возбудителем пищевых токсикоинфекций человека и одним из возбудителей газовой гангрены. Синтезирует протеиназы , лецитиназу, коллагеназу, гиалуронидазу и другие ферменты агрессивности. Продуцирует также токсины. α-токсин является фосфолипазой С, обладающей гемолитическими свойствами, ε-токсин является белком, образует поры в мембранах эпителиоцитов кишечника человека и вызывает выход ионов K+ и воды из клетки [1].

Геном

Геном Clostridium perfringens ATCC 13124 представлен кольцевой молекулой ДНК. Основные параметры генома представлены в таблице. Анализ файлов формата "ptt" позволяет предположить, что наиболее типичными для данной бактерии являются белки длиной 200-300 аминокислот. Встречаемость белков разных длин можно проследить на гистограмме, созданной с помощью Python [2].

  • [1]. Wikipedia: Clostridium perfringens
  • [2]. NCBI: Clostridium perfringens ATCC 13124, complete genome