Caladenia virus A – недавно открытый вирус, поражающий австралийские наземные орхидные.
Его полный геном состоит из 9847 нуклеотидов, которые кодируют 11 генетических продуктов, типичных
для большинства представителей семейства Potyviridae. Сравнение последовательностей показывает, что
наибольшее сходство (37,5-39,6%) Caladenia virus A имеет с вирусами рода Poacevirus, поэтому его предположительно
относят к данной таксономической группе. Метод распространения Caladenia virus A еще не был изучен,
однако в гене вспомогательного компонента протеазы (HCpro) была найдена последовательность, позволяющая
предположить, что Caladenia virus A, как и другие представители рода, может переноситься клещами.
Caladenia virus A — единственный известный представитель рода, извлеченный не из растений семейства
злаковых [1].
Геном вируса представлен линейной одноцепочечной молекулой РНК с положительной полярностью, т.е. молекула РНК
– плюс-цепь, имеет ту же последовательность нуклеотидов, что и мРНК, поэтому может незамедлительно
начать транслироваться. Стадия ДНК отсутсвтует [2].
Основные параметры генома вируса представлены в Таблице 1.
Описание аминокислотной последовательности полипротеина Caladenia virus A, а также копия Таблицы 1
находятся на странице отчета.
Caladenia virus A еще недостаточно изучен, поэтому подробная информация о строении вирусной частицы, механизмах
и признаках заражения отсутствует. В общем случае, для представителей рода Poacevirus характерно отсутствие
вирусной оболочки, волнообразная нитевидная форма, размеры около 680-750 нм в длину и 12-15 нм в диаметре,
спиральная симметрия. Вирион приблизительно на 95% состоит из белков и на 5% — из нуклеиновых кислот.
Репликация происходит в цитоплазме клетки-хозяина. В зараженных растениях наблюдаются характерные включения
[3],[4].
Таблица 1. Основные параметры генома вируса Caladenia virus A
| Параметр | Значение
|
| Латинское название вируса | Caladenia virus A |
| Русское название вируса | Вирус Каладении А |
| Количество фрагментов в полном геноме | 1 |
| Общая длина генома (п.н.) | 9847 |
| Количество кодируемых в геноме белков | 1 |
[1] Stephen J. Wylie, Aaron J. Y. Tan, Hua Li,
Kingsley W. Dixon, Michael G. K. Jones, Caladenia virus A, an unusual
new member of the family Potyviridae from terrestrial orchids in Western Australia,
Archives of Virology, December 2012, Volume 157, Issue 12, pp 2447-2452
[2]
NCBI: Caladenia virus A, genome
|
 |
| Caladenia arenicola, один из видов, поражаемых Caladenia virus A,
Wikimedia Commons |
 |
| Wheat curl mite (пшеничный клещ), один из возможных переносчиков Caladenia virus A,
DAF |
 |
| Вирион рода Poacevirus,Viral Zone |
|
