Изображение выравниваний

Мне было дано 6 идентификаторов Uniprot:

Я скачала их в FASTA-файл, открыла его в программе JailView (File - Input alignment - From file) и построила множественное выравнивание программой Muscle с параметрами по умолчанию (Web Service - Alignment - Muscle with defaults).

Последовательность с идентификатором E3HYT5_RHOVT очевидно отличалась от остальных. В ней было значительно больше гэпов, к тому же, был участок, где все последовательности, кроме этой, имели гэп. После удаления её из выравнивания число консервативных колонок возросло. Появились пустые колонки, которые я удалила. N- и C- концевые участки последовательностей оказались негомологичны, и их тоже пришлось удалить.
Изображение выравнивания в раскраске BLOSUM62 с порогом по консервативности 30% [1]
Нажмите на картинку, чтобы открыть ее в полном размере.

Ссылки:

[1]. Данное выравнивание было получено не из файла, а прямой загрузкой данных из Uniprot по идентификаторам (File - Fetch sequences - Uniprot), так как это показалось мне более удобным.