Филогенетическое дерево бактерий
Отобранные бактерии
| Название | Мнемоника |
|---|---|
| Clostridium tetani | CLOTE |
| Finegoldia magna | FINM2 |
| Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus | LACDA |
| Enterococcus faecalis | ENTFM |
| Streptococcus pneumoniae serotype 4 | STRPN |
| Listeria monocytogenes serovar 1/2a | LISMO |
| Staphylococcus aureus | STAAR |
| Staphylococcus epidermidis | STAES |
Скобочная формула дерева
((((STAAR, STAES), LISMO), ((ENTFM, STRPN), LACDA)), (CLOTE, FINM2));
Изображение дерева
Ветви дерева
Дерево содержит 5 нетривиальных ветвей:
{STAAR, STAES} против {LISMO, ENTFM, STRPN, LACDA, CLOTE, FINM2}
{STAAR, STAES, LISMO} против {ENTFM, STRPN, LACDA, CLOTE, FINM2}
{STAAR, STAES, LISMO, ENTFM, STRPN, LACDA} против {CLOTE, FINM2}
{ENTFM, STRPN, LACDA} против {STAAR, STAES, LISMO, CLOTE, FINM2}
{ENTFM, STRPN} против {STAAR, STAES, LISMO, CLOTE, FINM2, LACDA}
Таксономия выбранных бактерий
| Бактерия | Мнемоника | Таксономия |
|---|---|---|
| Clostridium tetani | CLOTE | Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; Clostridium |
| Finegoldia magna | FINM2 | Firmicutes; Tissierellia; Tissierellales; Peptoniphilaceae; Finegoldia |
| Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus | LACDA | Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Lactobacillaceae; Lactobacillus; Lactobacillus delbrueckii |
| Enterococcus faecalis | ENTFM | Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Enterococcaceae; Enterococcus |
| Streptococcus pneumoniae serotype 4 | STRPN | Firmicutes; Bacilli; Lactobacillales; Streptococcaceae; Streptococcus |
| Listeria monocytogenes serovar 1/2a | LISMO | Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Listeriaceae; Listeria |
| Staphylococcus aureus | STAAR | Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Staphylococcaceae; Staphylococcus |
| Staphylococcus epidermidis | STAES | Firmicutes; Bacilli; Bacillales; Staphylococcaceae; Staphylococcus |
Все отобранные бактерии относятся к типу Firmicutes. Внутри данного типа выдлеляется несколько классов, три из которых представлены в нашей выборке: Clostridia, Tissierellia и Bacilli. К классам Clostridia и Tissierellia в нашем случае принадлежит по одной бактерии - Clostridium tetani и Finegoldia magna соответсвенно. Остальные 6 представителей относятся к классу Bacilli. Из них 3 принадлежат отряду Lactobacillales и три - отряду Bacillales. Внутри Bacillales есть две бактерии, имеющие также одинаковые семейство (Staphylococcaceae) и род (Staphylococcus).
Нетривиальная ветвь {STAAR, STAES, LISMO, ENTFM, STRPN, LACDA} против {CLOTE, FINM2} отделяет класс Bacilli от всех остальных.
Ветвь {ENTFM, STRPN, LACDA} против {STAAR, STAES, LISMO, CLOTE, FINM2} отделяет отряд Lactobacillales, а ветвь {STAAR, STAES, LISMO} против {ENTFM, STRPN, LACDA, CLOTE, FINM2} - отряд Bacillales.
Ветвь {STAAR, STAES} против {LISMO, ENTFM, STRPN, LACDA, CLOTE, FINM2} отделяет семейство Staphylococcaceae.