Dashkevich

1. Глобальное парное выравнивание гомологичных белков

Таблица 1: Характеристики глобального парного выравнивания трёх пар белков

Protein Name	ID 1	ID 2	Score	% Identity	% Similarity	Gaps	Indels
Transcription-repair-coupling factor	MFD_ECOLI	MFD_BACSU	1839	32,7	54,7	153	22
Serine--tRNA ligase	SYS_ECOLI	SYS_BACSU	1093,5	51,6	67,1	9	4
UvrABC system protein B	UVRB_ECOLI	UVRB_BACSU	2048,5	58,5	77,7	12	4

2. Локальное парное выравнивание гомологичных белков

Таблица 2: Характеристики локального парного выравнивания трёх пар белков

Protein Name	ID 1	ID 2	Score	% Identity	% Similarity	Gaps	Indels	Coverage 1	Coverage 2
Transcription-repair-coupling factor	MFD_ECOLI	MFD_BACSU	1857	37,4	57,5	96	16	92,2 %	90,6 %
Serine--tRNA ligase	SYS_ECOLI	SYS_BACSU	1095,5	52,1	67,5	8	3	99,3 %	99,1 %
UvrABC system protein B	UVRB_ECOLI	UVRB_BACSU	2055,5	59,2	78,5	8	3	99 %	99,5 %

3. Результат применения программ выравнивания к неродственным белкам

Таблица 3: Характеристики глобального и локального парного выравнивания неродственных белков

	Protein Name 1	Protein Name 2	ID 1	ID 2	Score	% Identity	% Similarity	Gaps	Indels	Coverage 1	Coverage 2
Глобальное Выравнивание	3-sulfolactaldehyde reductase	Coproporphyrinogen III oxidase	SQUU_ECOLI	CGOX_BACSU	36,5	5,7 %	8,9 %	534	11
Локальное Выравнивание	3-sulfolactaldehyde reductase	Coproporphyrinogen III oxidase	SQUU_ECOLI	CGOX_BACSU	53	25,5 %	36,4 %	38	5	25,8 %	22,3 %

При выравнивании неродственных белков показатели веса и индентичности достаточно низкие (один из признаков негомологичности), количесво гэпов и инделей
значительно больше, чем при выравнивании родственных белков.

Выравнивание последовательностей