Задание №1
Я выбрала снежного барса Panthera uncia. Этот объект заинтересовал меня тем, что в отличии от шдругих представителей семейства кошачих, они не умеют рычать.У снежных барсов есть «основной» крик, описываемый как «пронзительный вой», который настолько громкий, что его можно услышать сквозь рев реки. Хромосомный набор - 38 хромосом.
Рисунок 1. Panthera uncia
Поисковый запрос: Panthera uncia (snow leopard)
В выдаче была 1 сборка.
Я её взяла , так как она является референсной (высококачественная, отобранная вручную сборка, которую NCBI и сообщество определили в качестве стандарта/примера)
и собрана на уровне хромосом.
Задание №2
Таблица 1. Характеристики выбранной сборки
| Идентификатор GenBank | GCA_023721935.1 |
| Идентификатор RefSeq | GCF_023721935.1 |
| Общий размер генома | 2.4 Gb |
| Число хромосом | 19 |
| Число скэффолдов | 2,635 |
| N50 для скэффолдов | 112.1 Mb |
| L50 для скэффолдов | 9 |
| Число контигов | 26,421 |
| N50 для контигов | 179.5 kb |
| L50 для контигов | 3,996 |
L50 - число контигов (скэффолдов) (наименьшее), в которых содержится половина (50%) всех нуклеотидов сборки.
N50 - длина контига (скэффолда), для которого половина (50%) всех нуклеотидов сборки содержится в контигах (скэффолдах) такой и большей длины.
Задание №3
Все необходимые файлы я скачала через сайт NCBI
