Задание №1
Таблица 1. Отобранные бактерии
| Название | Мнемоника |
|---|---|
| Acidothermus cellulolyticus | ACIC1 |
| Arthrobacter sp. | ARTS2 |
| Clavibacter michiganensis | CLAMS |
| Leifsonia xyli | LEIXX |
| Bifidobacterium longum | BIFLO |
| Corynebacterium diphtheriae | CORDI |
| Thermobifida fusca | THEFY |
| Rubrobacter xylanophilus | RUBXD |
Скобочная формула дерева
((((((LEIXX,CLAMS),ARTS2),BIFLO),(THEFY,ACIC1)),CORDI),RUBXD);
Изображение дерева
Ветви дерева
1. (THEFY,ACIC1) против (ARTS2,LEIXX,CLAMS,BIFLO,CORDI,RUBXD)
2. (LEIXX,CLAMS) против (THEFY,ACIC1,ARTS2,BIFLO,CORDI,RUBXD)
3. (ARTS2,LEIXX,CLAMS) против (THEFY,ACIC1,BIFLO,CORDI,RUBXD)
4. (ARTS2,LEIXX,CLAMS,BIFLO) против (THEFY,ACIC1,CORDI,RUBXD)
5. (CORDI,RUBXD) против (THEFY,ACIC1,ARTS2,LEIXX,CLAMS,BIFLO)
Таксономия для отобранных бактерий была взята с сайта NCBI
Таблица 2. Таксономия
| ACIC1 | ARTS2 | CLAMS | LEIXX | BIFLO | CORDI | THEFY | RUBXD | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Надцарство | Bacteria | Bacteria | Bacteria | Bacteria | Bacteria | Bacteria | Bacteria | Bacteria |
| Клада | Terrabacteria group | Terrabacteria group | Terrabacteria group | Terrabacteria group | Terrabacteria group | Terrabacteria group | Terrabacteria group | Terrabacteria group |
| Отдел | Actinomycetota | Actinomycetota | Actinomycetota | Actinomycetota | Actinomycetota | Actinomycetota | Actinomycetota | Actinomycetota |
| Класс | Actinomycetes | Actinomycetes | Actinomycetes | Actinomycetes | Actinomycetes | Actinomycetes | Actinomycetes | Rubrobacteria |
| Порядок | Acidothermales | Micrococcales | Micrococcales | Micrococcales | Bifidobacteriales | Mycobacteriales | Streptosporangiales | Rubrobacterales |
| Семейство | Acidothermaceae | Micrococcaceae | Microbacteriaceae | Microbacteriaceae | Bifidobacteriaceae | Corynebacteriaceae | Nocardiopsaceae | Rubrobacteraceae |
| Род | Acidothermus | Arthrobacte | Clavibacter | Leifsonia | Bifidobacterium | Corynebacterium | Thermobifida | Rubrobacter |
Из нетривиальных ветвей дерева ветвь (LEIXX,CLAMS) соответствует семейству Microbacteriaceae.
Из нетривиальных ветвей дерева ветвь (ARTS2,LEIXX,CLAMS) соответствует порядку Micrococcales.
Из нетривиальных ветвей дерева ветвь (ACIC1,ARTS2,LEIXX,CLAMS,BIFLO,CORDI,THEFY) соответствует классу Actinomycetes.
