| ГЛАВНАЯ | СЕМЕСТРЫ | О СЕБЕ | ССЫЛКИ |
Из списка была выбрана случайная последовательность - Q9NXZ6. Был проведен поиск PSI-BLAST по базе данных REfSeq. После первой итерации было получено 256 хороших находок (с E-value ниже порога в 0,005). Из них были убраны 16 белков низкого качества (low quality proteins) и 4 гипотетических белка. Затем была проведена вторая итерация, которая в результате дала 392 белка среди лучших находок. После третий итерации количество находок увеличилось до 500. Поскольку с каждым разом E-value худшей находки среди лучших уменьшался, то было проведно в конечном счете 5 итераций, взяты все белки, кроме 19 плохого качества и 1 гипотетического. Для них было построено множественное выравнивание, но поскольку память моего копмьютера не справляется с сохранением такого большого изображения то представлен, проект.
Плохие находки тоже были просмотрены, но после третьей итерации список с плохими находками перестал отображаться. Таблица с количеством итераций и находками.