Эволюционные домены. БД Pfam, InterPro.

1. Доменная структура белка ACPS_BACSU по данным Pfam

Cхема из Pfam:
Пояснения к схеме
№	Pfam AC	Pfam ID	Полное название семейства доменов	Положение в последовательности белка ACPS_BACSU	Клан
1.	PF01648	ACPS	Члены этого семейства превращают 4'-phosphopantetheine (4'- PP) из coenzyme А (CoA) в инвариантный серин из PF00550. Эта пост-трансляционная модификация делает holo-ACP способным к активации acyl группы через thioesterification из cysteamine thiol 4'-PP . Это надсемейство состоит из двух подтипов: типа ACPS таких как P24224 и типа Sfp таких как P39135. Структуры типа Sfp показывают активный центр, который вмещает ион магния. Наиболее высоко консервативных участках выравнивания присутствуют в связывании ионы магния.	5–73	Отсутствует

2. Домен ACPS:

• Домен входит в 27 разных архитектур.
• Последовательность известна для 3430 белков, содержащих домен.
• Для 12 разных белков, содержащих домен определена пространственная структура белка.
• Выравнивание "seed" фрагментов белков, соответствующих домену.

3. Представленность домена PF02603 в организмах разных видов

Я выбрала белок HPRK_BACSU с 2-умя доменами.

Представленность домена PF02603 в организмах разных видов

Представленность изучаемых доменов в белках Bacillus subtilis

Примеры разных доменных перестроек

Домен PF02603 (Hpr_kinase_N)

1. 7 архитектурных перестроек, содержащих только этот домен

A5M832_STRPN:

2. Встроенный домен

HPRK_FUSNN:

3. Сложная доменная архитектура

Домен PF07475 (Hpr_kinase_C)

1. Архитектурные перестройки, содержащие только этот домен

Q8TV81_METKA:

2. Дубликация

C6JM50_FUSVA:

3. D0D026_9RHOB: