Понятие о выравнивании.

1. Выравнивание последовательностей с помощью программы GeneDoc:

Процент идентичности двух последовательностей: (13/22)*100%=59,1%

Процент сходства двух последовательностей: (14/22)*100%=63,6%

2. Координаты (начало и конец) последовательности seq1 в полной последовательности моего белка (ACPS_BACSU): 55-74

3. Выравнивание моего белка ACPS_BACSU и белка ACPS_VIBCH:

а) Организмы: ACPS_BACSU - Bacillus subtilis; ACPS_VIBCH - Vibrio cholerae.

б) Процент идентичности: 55/127 (43%)

в) Процент сходства: 79/127 (62%)

г) Число гэпов: 11/127 (9%)

д) Координаты выровненного участка: 1-118 у ACPS_BACSU и 1-125 у ACPS_VIBCH

Карта локального сходства: