Главная (Main)

A- и В- формы ДНК.

Задание3: Сравнение структур 3-х форм ДНК с помощью средств RasMol.

В- форма:

В сторону большой бороздки обращены атомы: C8.C6, C8.C5, C8. N3, C8.N4
В сторону малой бороздки обращены атомы : C8.C2, C8.O2, C8.N3
Остальные атомы основания : C8.N1

A - форма:

В сторону большой бороздки обращены атомы: С24. N4, С24.С4, C24.N3,С24.С2, C24.O2
В сторону малой бороздки обращены атомы : C24.N1, C24.C6, C24.C5
Остальные атомы основания : -

Z - форма:

В сторону большой бороздки обращены атомы: C18.C2, C18. O2, C18.N3
В сторону малой бороздки обращены атомы : C18.C6, C18. C5
Остальные атомы основания : : C18.C4, C18.N1, C18.N4

Упр.2: Сравнение основных спиральных параметров разных форм ДНК.

	А-форма	В-форма	Z-форма
Тип спирали	Правозакрученная	Правозакрученная	Левозакрученная
Шаг спирали (Å)	28.03	33.75	43.50
Число оснований на виток	11	10	12
Ширина большой бороздки (Å)	6.74 (по цитозину)	14.45 (по гуанину)	5.03 (по гуанину)
Ширина малой бороздки (Å)	19.54 (по тимину)	10.90 (по цитозину)	6.69 (по гуанину)

Упр.3: Сравнение торсионных углов в структурах А- и В-форм.

	α (P-O5')	β (O5'-C5')	γ (C5'-C4')	δ (C4'-C3')	ε (C3'-O3')	ζ (O3'-P)	χ (C1'-N)
А-DNA	-51.68^o	174.79^o	46.25^o	79.03^o или -161.78^o	169.09^o	-97.38^o	-94.88^o
В-DNA	-29.87^o	136.32^o	31.14^o	143.35^o или -98.84^o	-140.76^o	-160.49^o	-97.95^o

© Лунева Анна