Главная (Main)

Занятие 8. Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)

1. Определение метаболических путей, в которых участвует фермент OCTC_HUMAN

KEGG-идентификатор hsa:54677

Фермент участвует в одном метабоолическом пути: Peroxisome (пероксисома, hsa04146).

Карта найденного пути:

2. Поиск в KEGG структурных формул сукцината и фосфоенолпирувата

Succinate (Succinic acid; Butanedionic acid; Ethylenesuccinic acid): C00042

Phosphoenolpyruvate (Phosphoenolpyruvic acid; PEP): C00074

3. Поиск метаболического пути от сукцинат до фосфоенолпируват

Карта: Цитратный цикл

Путь: сукцинат → фосфоенолпируват

4. Сравнение метаболических путей у разных организмов

Возможность выбранной цепочки ферментативных реакций в разных организмах

Организм Цепочка реакций возможна Обоснование
Bacillus subtilis нет есть фермент только для первой реакции
Archaeoglobus fulgidus нет нет ферментов двух реакций
Arabidopsis thaliana нет есть ферменты только для второй реакции
Homo sapiens нет есть фермент только для первой реакции

© Лунева Анна