1. Построение и оптимизация с помощью MOPAC структуры нафталина и азулена.
Нафталин:
Изначально полученная структура азулена оказалась не плоской,после применения силового поля UFF получили плоскую структуру:
2. Входные файлы для оптимизации геометрии средствами GAMESS:
Результаты вычислений GAMESS:
3. На основе полученных координат составили новые входные файлы для расчёта энергии.
Файлы для расчёта методом Хартри-Фока:
Файлы для расчета по теории функционала плотности:
Файлы с результатами:
nap_har.log, myazu_har.log, nap_tf.log, myazu_tf.log
4. В файлах расчёта энергии выписали значения энергии "TOTAL ENERGY = " в таблицу:
Вещество | E(naptalene) | E(azulene) | Δ E , Hartree | Δ E, kCal/mol |
Хартри-Фок | -383.3549061523 | -383.2821983833 | 0,072707769 | 45.624813517 |
DFT | -385.6401306541 | -385.5852600960 | 0,0548705581 | 34,431794777 |
Из эксперимента известно, что энергия изомеризации нафталина в азулен составляет 35.3±2.2 kCal/mol.
Поэтому, по полученным результатом, можно сделать вывод, что расчет по теории функционала плотности дает более точный результат.