Краткое описание генома бактерии Gemmatimonas phototrophicaGemmatimonas phototrophica один из двух видов, относящихся к роду Gemmatimonas, единственному в типе Gemmatimonadetes [1]. Это вид красно-пигментированных полуаэробных бактерий, которые были найдены в пресноводном озере в пустыне Гоби. Бактерия Gemmatimonas phototrophica имеет полностью функционирующий фотосинтезирующий реакционный центр 2 типа(феофитин-хиноновый), но при этом она не усваивает неорганический углерод, что означает, что эта бактерия фотогетеротроф. В её геноме есть кластер фотосинтезирующих генов(PGC), из-за устройства и филогении которых сделали вывод, что в древности произошёл горизонтальный перенос этого кластера от пурпурных фототрофных бактерий. [2]. По анализу организмов со схожим с Gemmatimonas phototrophica геномом можно предположить, что этот вид распостранён в различнах средах обитания: воздух, пресноводные водоёмы, грунт, приливная зона, но никогда в морской воде[3]. Геном бактерии, секвенированный в 2014 году[2], состоит из 4716552 пар нуклеотидов, в нём обнаружено 3965 генов[4]Источники: [1]Wikipedia Gemmatimonas. [2]Functional type 2 photosynthetic reaction centers found in the rare bacterial phylum Gemmatimonadetes. Zeng Y1, Feng F2, Medova H1, Dean J1, Koblizek M3. [3]Metagenomic evidence for the presence of phototrophic Gemmatimonadetes bacteria in diverse environments. Zeng Y1,2, Baumbach J3, Barbosa EG3,4, Azevedo V4, Zhang C5, Koblizek M2. [4]NCBI Gemmatimonas phototrophica strain AP64, complete genome. ©Шкарина Анастасия Николаевна 2016 |