Нуклеотидные банки данных

Таксономия и функции прочтений.

Эта последовательность имеет 100% сходство с очень маленьком e-value(2e-149) с последовательность гена рибосомальной РНК(SF-2015a gene for 18S ribosomal RNA) организма из рода(Orzeliscus sp.) тихоходок(Tardigrada).

Сравнение алгоритмов BLAST

Результаты поиска с помощью Blastn
Число находок: 100
Длина слова:28
Результаты поиска с помощью Discontiguous megablast
Число находок: 100
Длина слова:11
Результаты поиска с помощью Megablast
Число находок: 100
Длина слова:11

Проверка гомологии белков в одном организме.

Далее предствалены ссылки на выдачу программы tblast при поиске гомологов следующих белков:
HSP7C_HUMAN, CISY_HUMAN, EIF3G_SCHPO

Поиск одного гена в скэффолде.


©Шкарина Анастасия Николаевна 2016