Нуклеотидные банки данных
Таксономия и функции прочтений.
Эта последовательность имеет 100% сходство с очень маленьком e-value(2e-149) с последовательность гена рибосомальной РНК(SF-2015a gene for 18S ribosomal RNA)
организма из рода(Orzeliscus sp.) тихоходок(Tardigrada). | |
Сравнение алгоритмов BLAST
Результаты поиска с помощью Blastn |
Число находок: 100 Длина слова:28 | |
Результаты поиска с помощью Discontiguous megablast |
Число находок: 100 Длина слова:11 | |
Результаты поиска с помощью Megablast |
Число находок: 100 Длина слова:11 | |
Проверка гомологии белков в одном организме.
Далее предствалены ссылки на выдачу программы tblast при поиске гомологов следующих белков:
HSP7C_HUMAN, CISY_HUMAN, EIF3G_SCHPO
Поиск одного гена в скэффолде.
©Шкарина Анастасия Николаевна 2016
|