Филогенетическое дерево

Задание 1

Отобранные бактерии

НазваниеМнемоника
Rhizobium etliRHIEC
Neisseria meningitidisNEIMA
Pseudomonas aeruginosaPSEAE
Salmonella typhimuriumSALTY
Pasteurella multocidaPASMU
Proteus mirabilisPROMH
Ralstonia solanacearumRALSO

Скобочная формула дерева

(RHIEC,((RALSO,NEIMA),(PSEAE,((SALTY,PROMH),PASMU))))


4 нетривиальные ветви:

  1. {SALTY,PROMH} против {RHIEC,RALSO,NEIMA,PSEAE,PASMU}
  2. {SALTY,PROMH,PASMU} против {RHIEC,RALSO,NEIMA,PSEAE}
  3. {SALTY,PROMH,PASMU,PSEAE} против {RHIEC,RALSO,NEIMA}
  4. {RHIEC,SALTY,PROMH,PASMU,PSEAE} против {RALSO,NEIMA}

Задание 2

Таксономия бактерий

НазваниеТаксономия
Rhizobium etliBacteria
Proteobacteria
Alphaproteobacteria
Rhizobiales
Neisseria meningitidisBacteria
Proteobacteria
Betaproteobacteria
Neisseriales
Pseudomonas aeruginosaBacteria
Proteobacteria
Gammaproteobacteria
Pseudomonadales
Salmonella typhimuriumBacteria
Proteobacteria
Gammaproteobacteria
Enterobacterales
Salmonella
Pasteurella multocidaBacteria
Proteobacteria
Gammaproteobacteria
Pasteurellales
Proteus mirabilisBacteria
Proteobacteria
Gammaproteobacteria
Enterobacterales
Morganellaceae
Proteus
Ralstonia solanacearumBacteria
Proteobacteria
Betaproteobacteria
Burkholderiales
Burkholderiaceae
Ralstonia

Соответствие топологии и нетривиальных ветвей

ТаксонНетривиальная ветвь
Betaproteobacteria{RHIEC,SALTY,PROMH,PASMU,PSEAE} против {RALSO,NEIMA}
Gammaproteobacteria{SALTY,PROMH,PASMU,PSEAE} против {RHIEC,RALSO,NEIMA}
Enterobacterales{SALTY,PROMH} против {RHIEC,RALSO,NEIMA,PSEAE,PASMU}
©Шкарина Анастасия Николаевна 2016