HMM профль и ROC-кривая

Для данного практикума был выбран домен PF00969 семейства MHC_II_beta.
database:(type:pfam id:PF00969) taxonomy:"Eutheria [9347]" AND reviewed:yes
На основе первых 15 последовательностей было построиено выравнивание:
Ссылка на выравнивание
Ссылка на файл с HHM профилем
Ссылка на файл Excel с результатами
Гистограмма распределения весов

ROC-кривая

Был выбран порог по весу: 410. Это значит, что при равно или большем весе, можно сказать, что последовательность принадлежит целевому семейству.

Как мы видим, все показатели очень хорошие, что говорит о том, что профиль крайне специфичен и его можно считать достоверным. Это также можно было сказать по площади под графиком ROC-кривой. Так как она почти единица, значит по Score можно предсказать класс почти абсолютно точно. Возможно, это связано с функцией MHC_II_beta. Это главный комплекс гистосовместимости, который играет важнейшую роль в развитии иммунного ответа.