RNPH_BACSU protein

General information ^[UniProt]

Recommended name: Ribonuclease PH.
Short name: RNase PH.
Alternative name(s): tRNA nucleotidyltransferase.

Function: Phosphorolytic exoribonuclease that removes nucleotide residues following the -CCA terminus of tRNA and adds nucleotides to the ends of RNA molecules by using nucleoside diphosphates as substrates.

Catalytic activity: tRNA(n+1) + phosphate = tRNA(n) + a nucleoside diphosphate.

Identifiers

UniProt: P28619 (RNPH_BACSU)
RCSB PDB: 1OYP
ExPASy CH: 2.7.7.56

Characteristics ^[Wikipedia]

RNase PH is an 3'-5' exoribonuclease and nucleotidyltransferase, present in archaea and bacteria, that is involved in tRNA processing. Contrary to hydrolytic enzymes, it is a phosphorolytic enzyme, meaning that it uses inorganic phosphate as a cofactor to cleave nucleotide-nucleotide bonds, releasing diphosphate nucleotides. The active structure of the proteins is actually a homohexameric complex, consisting of three RNase PH dimers.

Peptide sequence

Sequence length (number of amino acid residues): 245.

Amino acid sequence:

10 20 30 40 50 60
MRHDGRQHDE LRPITFDLDF ISHPEGSVLI TAGNTKVICN ASVEDRVPPF LRGGGKGWIT

70 80 90 100 110 120
AEYSMLPRAT NQRTIRESSK GKISGRTMEI QRLIGRALRA VVDLEKLGER TIWIDCDVIQ

130 140 150 160 170 180
ADGGTRTASI TGAFLAMAIA IGKLIKAGTI KTNPITDFLA AISVGIDKEQ GILLDLNYEE

190 200 210 220 230 240
DSSAEVDMNV IMTGSGRFVE LQGTGEEATF SREDLNGLLG LAEKGIQELI DKQKEVLGDS

LPELK

Download sequence (*.fasta).

New information (block 2)

Protein molecular mass: 26681,13716 Da.
Residue molecular mass mean value: 108,82907 Da.

Белок RNPH_BACSU

Общая информация ^[UniProt]

Рекомендованное название: Рибонуклеаза PH.
Короткое название: РН-аза PH.
Другое название (другие названия): РНК нуклеотидилтрансфераза.

Функция: Фосфоролитическая экзорибонуклеаза, которая удаляет нуклеотидные остатки, следующие за -ЦАА концом т-РНК, и добавляет нуклеотиды к концам молекул РНК использованием нуклеозиддифосфатов в качестве субстратов.

Каталитическая функция: т-РНК(n+1) + фосфат = т-РНК(n) + нуклеозиддифосфат.

Идентификаторы:

UniProt: P28619 (RNPH_BACSU)
RCSB PDB: 1OYP
ExPASy CH: 2.7.7.56

Характеристика ^[Wikipedia]

РН-аза PH является 3'-5' экзорибонуклеазой и нуклеотидилтрансферазой, присутствующей в клетках архей и бактерий и участвующей в т-РНК процессинге. В противоположность гидролитическим ферментам, она представляет собой фосфоролитический фермент, т. е. использует фосфат неорганический в качестве кофактора для разрыва нуклеотид-нуклеотидной связи с образованием нуклеотиддифосфатов. Рабочая структура, по сути, — |гомогексамерный комплекс|, состоящий из трех димеров фермента РН-аза PH.

Аминокислотная последовательность

Длина последовательности (количество аминокислотных остатков): 245.

Последовательность аминокислотных остатков: