8. Киотская энциклопедия генов и геномов (KEGG)
1. В каких метаболических путях участвует фермент MECR_HUMAN
Мой фермент --- MECR_HUMAN.
Работаю с геном (идентификатор hsa:51102) в базе KEGG.
С геном ассоциированы два метаболических пути:
| Идентификатор | Английское название | Русское название |
| hsa00062 | Fatty acid elongation | LACDA |
| hsa01100 | Metabolic pathways | LACLM |
Карта пути "Fatty acid elongation"
2. Структурные формулы фосфоенолпирувата и L-тирозина
Мои 2 вещества:
| Название на русском языке | Название на английском языке | Идентификатор | Структурная формула |
| Фосфоенолпируват | Phosphoenolpyruvate | C00074 |  |
| L-тирозин | L-tyrosine | C00082 |  |
3. Метаболический путь от фосфоенолпирувата к L-тирозину
Ищу метаболический путь, связывающий фосфоенолпируватс с L-тирозином. Поиск выдал список из нескольких карт. Подходящей оказалась карта ko00400 (Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis / Биосинтез фенилаланина, тирозина и триптофана). Вещества соединяют несколько путей (все однонаправленные --- от фосфоенолпирувата к L-тирозину), кратчайшие из которых отмечены на картинке.
Выбранная цепочка ферментативных реакций
Карта: Биосинтез фенилаланина, тирозина и триптофана.
Путь: фосфоенолпируват → L-тирозин
4. Сравнение метаболических путей у разных организмов
Определяю, возможна ли выбранная цепочка ферментативных реакций у следущих организмов.
Возможность выбранной цепочки ферментативных реакций в разных организмах
| Организм | Цепочка реакций возможна (да/нет/неизвестно) | Обоснование |
| Bacillus subtilis | нет | из 18 необходимых ферментов найдены гены только для 11 |
| Archaeoglobus fulgidus | нет | из 18 необходимых ферментов найдены гены только для 8 |
| Arabidopsis thaliana | нет | из 18 необходимых ферментов найдены гены только для 11 |
| Homo sapiens | нет | из 18 необходимых ферментов найдены гены только для 2 |
