Описание короткоцепочечной дегидрогеназы из генома бактерии Burkholderia cepacia JBK9

Последовательность аминокислот:

>ALX10644 short-chain dehydrogenase
mktvlivgasrglgrefvrqyrrdgwnviatarddasldalralgaqahaldiaqpeqia
algwkldgerldaavlvsgvygprtegvetvtaedfdavmhtnvrgpmqllpillplved
argvlavvssrmgsiaeatgttgwlyraskaalndalriaslqtrhaacislhpgwvrtd
mggaqaaidpetsvtgmrrviaesgsdvsqangrffqydgielsw

Таблица 1. Описание белка короткоцепочечной дегидрогеназы из генома бактерии Burkholderia cepacia JBK9

Идентификатор белка	ALX10644.1
Идентификатор генома	CP013730.1
Название белка (на англ. языке)	Short-chain dehydrogenase
Координаты гена в геноме	719612..720289
Длина гена (в парах нуклеотидов)	678
Цепь	Обратная
Длина белка (в аминокислотных остатках)	225

Рисунок 1. Геномное окружение гена белка короткоцепочечной дегидрогеназы (идентификатор белка ALX10644.1). Изображение получено с помощью геномного браузера NCBI. Описание: На рисунке сверху показаны шесть рамок считывания. Зелёными вертикальными линиями на рисунке обозначены старт-кодоны, стоп-кодоны - красными. Серые линии обозначают открытые рамки считывания. Исследуемый белок ALX10644.1 находится на рамке считывания -3. Соседние белки ALX10643.1 (функция белка неизвестна) (у 5'-конца) и ALX10645.1 (белок карбоангидразы) (у 3'-конца) также находятся на рамке считывания -3. Под блоком с рамками считывания схематично изображены гены. По направлению белых стрелок на красном фоне можно определить, что исследуемый белок закодирован на обратной цепи ДНК.