Практикум 1. Визуализация молекул в J(S)Mol

Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре
#	Имена атомов	Длина связи (Å)	Угол N-O-C (°)
Альфа-спирали
1	N(370GLU)--O(338PRO)	2,98	150,3
2	N(315HIS)--O(287SER)	2,98	160,8
3	N(427GLU)--O(401VAL)	3,35	143,9
4	N(390ASP)--O(364GLU)	3,42	148,1
5	N(379ALA)--O(345ILE)	2,89	157,6
Бета-тяжи
1	N(136GLY)--O(163LEU)	2,77	158,0
2	N(163LEU)--O(134ILE)	2,80	166,8
3	N(161ALA)--O(132ARG)	3,77	130,1
4	N(165ALA)--O(136GLY)	2,90	169,9

Данные таблицы были получены с помощью измерений в программе Jmol. По результатам измерений средняя длина водородной связи в альфа-спиралях составила 3,014 Ангстрем, а угол - 157,94°. В бета-тяжах средняя длина водородной связи составляет 3,06 Ангстрем, а угол - 156,2°. В соответствии со стандартами, длина водородной связи приблизительно составляет 3,5 Ангстрема, а угол - 180°, с возможными отклонениями в 35-40°. Среди измеренный самая длинная связь имеет длину в 3,77 Ангстрема, а самый большой угол составил 169,9°. По полученным данным можно утверждать, что характеристики водородных связей не сильно отклоняются от нормы.