BLAST

Таблица 1. Характеристики списка находок и изменение длины слова.

Длина слова	Число результатов	E-value < 0.001	Макс. E-value	Предел
6	50	16	4.90	Максимум E-value
2	100	100	0.0002	Максимальное число результатов
2	375	125	10.00	Максимум E-value

Поиск произвдился программой BLAST для белка Short-chain dehydrogenase (AC: ALX10644.1) из бактерии Burkholderia cepacia strain JBK9.

Таблица 2. Изменение объёма поиска

ID	AC	Организм	Поиск по таксону	E-value до	E-value после
BDHA_CUPNH	Q9X6U2.2	Ralstonia eutropha H16	Proteobacteria	4*10-4	10-4

В результате выбора банка последовательностей меньшего объёма E-value уменьшился в 4 раза. Из этого можно сделать вывод о том, что объем банка протеобактерий в 4 раза меньше, чем весь банк последовательностей SwissProt.