Поиск информации о белке Beta-agarase B в Uniprot
Таблица с общей информацией о белке.
Uniprot ID | Uniprot AC | Refseq ID | PDB ID | Длина, а/к | Молекулярная масса, Да | Рекомендуемое Uniprot название |
AGAB_ZOBGA | Q9RGX8 | WP_013994901.1 | 1O4Z 4ATF |
353 | 40675 | Beta-agarase B |
Комментарий. Белок состоит из 4 цепей: A, B, C, D. Интересно отметить, что по данным PDB коду 1O4Z соответствует белок с длиной 346 аминокислотных остатков, а 4ATF - 308 остатков. Это связано с тем, что белки по этим кодам PDB начинаются с 19 и 53 остатков соответственно. Всего же в белке 353 остатка.
Таблица с информацией о кластерах.
Uniref | Cluster ID | Cluster Name | Size |
Uniref100 | UniRef100_Q9RGX8 | Beta-agarase B | 1 |
Uniref90 | UniRef90_Q9RGX8 | Beta-agarase B | 6 |
Uniref50 | UniRef50_Q9RGX8 | Beta-agarase B | 23 |
Таблица с результатами сеансов поиска в Uniprot.
Тип запроса | Запрос | Reviewed (SwissProt) |
Unreviewed (TrEMBL) |
Всего |
Название белка | name:"beta agarase b" | 2 | 13 | 15 |
Среди белков организма | name:"beta agarase b" organism:"zobellia galactanivorans" | 1 | - | 1 |
Среди белков семейства | name:"beta agarase b" taxonomy:flavobacteriaceae | 1 | 1 | 2 |
Среди белков отдела | name:"beta agarase b" taxonomy:"bacteroidetes" | 1 | 2 | 3 |
Поиск лизоцима | name:"lysozyme" | 239 | 24008 | 24247 |
Поиск лизоцима у зеленых растений | name:"lysozyme" taxonomy:"viridiplantae" | 3 | 25 | 28 |
Поиск лизоцима у инфузорий | name:"lysozyme" taxonomy:"ciliophora" | - | 15 | 15 |
Поиск трипсина | name:"trypsin" | 311 | 18640 | 18951 |
Поиск ингибиторов трипсина | name:"trypsin" name:"inhibitor" | 210 | 3704 | 3914 |