Главная
О себе
Список курсов
Сайт ФББ

Поиск информации о белке Beta-agarase B в Uniprot

Таблица с общей информацией о белке.

Uniprot ID Uniprot AC Refseq ID PDB ID Длина, а/к Молекулярная масса, Да Рекомендуемое Uniprot название
AGAB_ZOBGA Q9RGX8 WP_013994901.1 1O4Z
4ATF
353 40675 Beta-agarase B

Комментарий. Белок состоит из 4 цепей: A, B, C, D. Интересно отметить, что по данным PDB коду 1O4Z соответствует белок с длиной 346 аминокислотных остатков, а 4ATF - 308 остатков. Это связано с тем, что белки по этим кодам PDB начинаются с 19 и 53 остатков соответственно. Всего же в белке 353 остатка.

Таблица с информацией о кластерах.

Uniref Cluster ID Cluster Name Size
Uniref100 UniRef100_Q9RGX8 Beta-agarase B 1
Uniref90 UniRef90_Q9RGX8 Beta-agarase B 6
Uniref50 UniRef50_Q9RGX8 Beta-agarase B 23

Таблица с результатами сеансов поиска в Uniprot.

Тип запроса Запрос Reviewed
(SwissProt)
Unreviewed
(TrEMBL)
Всего
Название белка name:"beta agarase b" 2 13 15
Среди белков организма name:"beta agarase b" organism:"zobellia galactanivorans" 1 - 1
Среди белков семейства name:"beta agarase b" taxonomy:flavobacteriaceae 1 1 2
Среди белков отдела name:"beta agarase b" taxonomy:"bacteroidetes" 1 2 3
Поиск лизоцима name:"lysozyme" 239 24008 24247
Поиск лизоцима у зеленых растений name:"lysozyme" taxonomy:"viridiplantae" 3 25 28
Поиск лизоцима у инфузорий name:"lysozyme" taxonomy:"ciliophora" - 15 15
Поиск трипсина name:"trypsin" 311 18640 18951
Поиск ингибиторов трипсина name:"trypsin" name:"inhibitor" 210 3704 3914