Burkholderia cenocepacia — вид грамотрицательных аэробных бактерий, распространенных повсеместно, но чаще всего встречающихся в почве. Эти бактерии патогенны для людей, больных муковисцидозом и могут вызвать серьезные осожнения этой болезни. Инфецирование Burkholderia cenocepacia особенно проблематично, поскольку этот организм имеет высокий уровень устойчивости к антибиотикам, что делает его трудно искоренимым. В результате хронической инфекции может возникнуть тяжелое снижение функции легких. В связи с увеличением смертности, от больного муковисцидозом, являющегося членом эпидемии ET12 линии, которая возникла в Канаде или Великобритании и распространилась на Европу, был выделен штамм J2315 бактерии Burkholderia cenocepacia. Геном этого возбудителя инфекции включает в себя три круговые хромосомы и плазмиду и кодирует широкий спектр функций, характерных для этого метаболически универсального рода. Хотя штаммы B. cenocepacia могут быть выделены из почвы и можгут быть патогенными и для растений и для человека, J2315 является представителем рода B. cenocepacia, изолированым от окружающей среды. Бактерии из этого штамма распространяются между пациентами с муковисцидозом. Сравнительный анализ показал, что около 21% генома J2315 является уникальным по сравнению с другими штаммами B. cenocepacia, что говорит о геномной пластичности этого вида. [1]
Размер генома(п.н.): 8 055 782
Количество генов: 7 273
Дата секвенирования генома: 2008.11.14
Источники:
1. Matthew T. G. Holden, Helena M. B. Seth-Smith, Lisa C. Crossman, Mohammed Sebaihia, Stephen D. Bentley, Ana M. Cerdeño-Tárraga, Nicholas R. Thomson, Nathalie Bason, Michael A. Quail, Sarah Sharp, Inna Cherevach, Carol Churcher, Ian Goodhead, Heidi Hauser, Nancy Holroyd, Karen Munga, Paul Scott, Danielle Walker, Brian White, Helen Rose, Pernille Iversen, Dalila Mil-Homens, Eduardo P. C. Rocha, Arsenio M. Fialho, Adam Baldwin, Christopher Dowson, Bart G. Barrell, John R. Govan, Peter Vandamme, C. Anthony Hart, Eshwar Mahenthiralingam, and Julian Parkhill, The genome of Burkholderia cenocepacia J2315, an epidemic pathogen of cystic fibrosis patients, J Bacteriol. 2009 January; 191(1): 261–277.