Uniprot и Refseq Protein

Главная Семестры Обо мне Cайт ФББ МГУ
Таблица 1. Общая информация о белке
Uniprot IDB4EAZ8_BURCJ
Uniprot ACB4EAZ8
Refseq IDWP_006485075.1; NC_011000.1
PDB ID4WEO
Длина258
Молекулярная масса27278Da
Рекомендуемое Unirpot название -
Submitted name Putative acetoin(Diacetyl) reductase
Комментарии к таблице. В записи PDB белок представлен четырьмя цепями, и структура известна для всех этих цепей.

Таблица 2. Описание кластеров Uniref
Идентификатор кластераКоличество белков в кластереЕще что-то, заслуживающее внимание
UniRef50_Q39FN1133Среди организмов встречаются бактерии других родов
UniRef90_Q39FN190Среди организмов все еще встречаются представители друго вида, что вызвано быстротой эволюции бактерий и нечетким определением понятий рода и вида, особенно у прокариот
UniRef100_U1XRY42Здесь бактерии уже одного вида


Таблица 3. Результаты сеансов поиска в Uniprot
Текст запросаСколько нашлось белковСколько белков из раздела Reviewed
name:putative name:acetoin name:diacetyl name:reductase440
ename:putative name:acetoin name:diacetyl name:reductase taxonomy:"Burkholderiaceae [119060]"20
name:putative name:acetoin name:diacetyl name:reductase taxonomy:"Proteobacteria [1224]"160
name:myoglobin786145
name:name:myoglobin taxonomy:"Vertebrata [7742]"653123
name:myoglobin taxonomy:"Arthropoda [6656]"10
name:trypsin11309301
name:trypsin name:inhibitor2558203


© Иванова Антонина, 2015