| Главная | Семестры | Обо мне | Сайт ФББ МГУ |
Ход работы
Мне были даны 6 идентификаторов последовательностей, которые я скачала в fasta-формате из Uniprot. Сам fasta-файл можно скачать здесь. С помощью программы Muscle в JalView я построила множественное выравнивание последовательностей. После раскраскии по BLOSUM62, увидела, что последовательность с идентификатором K4KL90_SIMAS оказалось не гомологичной остальным. Можно посмотреть, как выглядело выравнивание до и после удаления лишней последовательности:
К тому же, картинка выше иллюстрирует выравнивание, в раскраске BLOSUM62 с порогом по консервативности 30%.
Итоги проведённой работы
'ID' лишней последовательности: K4KL90_SIMAS
6 последовательностей в fasta-формате
Выравнивание, полученное во 2 задании в формате fasta
Выравнивание, полученное во 2 задании в формате msf
Окончательный jvp-проект с тремя окнами
© Иванова Антонина, 2016