Описание
бактерии Photobacterium profundum, её протеома:
|
Царство: |
Bacteria |
|
Тип: |
Proteobacteria |
|
Класс: |
Gammaproteobacteria |
|
Порядок: |
Vibrionales |
|
Семейство: |
Vibrionaceae |
|
Род: |
Photobacterium |
|
Вид: |
P. profundum |
|
|
Рис1: Микрофотография SS9, Рис.2:
Жгутик(www.sciencemag.org)
Размеры:
диаметр: 0.8-1.3 мкм,
длина: 1,8-2,4 мкм
Среда обитания,
условия обитания:
Морские организмы. Могут
обитать в океанических глубинах, при высоком давлении.
Почему геном
секвенирован:
Photobacterium profundum
SS9 - прекрасная модель исследования адаптаций к низким температурам и высоким
давлениям. Геном секвенирован для оценки возможности существования других
организмов в условиях высокого давления, низких температур (по количеству
ненасыщенных жирных кислот, морфологическим и физиологическим свойствам,
структуре ДНК).
Структура генома:
источник) :
Статистические данные о
геноме Photobacterium profundum:
|
Хромосома или плазмида |
Количество белков |
Тип |
Число пар нуклеотидов |
CDS длина гена |
Суммарная длина межгенных промежутков |
Суммарная длина генов |
Число генов |
|
Хромосома1/td> |
3414d> |
кольцевая |
4085304 |
983.555 |
42% |
82% |
3414 |
|
Хромосома 2 |
1997 |
кольцевая |
2237943 |
901.439 |
41.2% |
80% |
1997 |
|
Плазмида pPBPR1 |
67 |
кольцевая |
80033 |
876.851 |
44% |
73% |
67 |
|
|
5328 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Рис1: Аминокислотный состав белков,
Рис.2: Распределение длины белков, Рис.3: Использование Триплета