Показано расстояние между контактирующими атомами,
оно должно быть меньше 4Å.
- Пример водородной связи, где донором и акцептором является атом О
Расстояние не должно превышать 3.5Å.
- Пример водородной связи, где донором и акцептором является атом N
В моем белке нет водородной связи, где донором и акцептором является атом N, так как нет атомов азота находящихся на расстоянии 3.5Å.
- Пример дисульфидного мостика
Дисульфидные мостики в инсулине. В инсулине их 6.Обозначены желтыми штрихами. А атомы серы обозначены желтыми шариками.
В моем белке дисульфидных мостиков нет.