1. Статья о структуре 1doz "Structural and Mechanistic Basis of Porphyrin Metallation by Ferrochelatase"
2. Гомологи 1doz.
3. Характеристика белка
   • a. Феррохелатаза, фермент, катализирующий металлирование порфирина IX на последней стадии биосинтеза гема, был ко-кристаллизован с изомерной смесью сильного ингибитора N-метилмезопорфирина (N-MeMP). Ренгеноструктура выявила активный сайт белка, к которому связывается один из изомеров, что позволило охарактеризовать нарушение макроцикла порфирина из-за инактивации феррохелатазы. Структура феррохелатазы и N-MeMP закристаллизованы в присутствии Cu²⁺, это привело к металлированию и деметелированию N-MeMP. Предложен механизм нарушения цикла порфирина.
   • b. Разрешение структуры - 20.0-1.8
   • c. Фазовая проблема решена методом молекулярного замещения.
   • d. 27 034 структурных факторов измерено и 91.0 % имеют силу сигнала более 3.0
   • e. R-factor - 17.7 % (R-free - 20.5 %)

   Выравнивание, построенное с помощью программы JalView:
   

   >1DOZ:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE/1-309
   -SRKKMGLLVMAYGTPYKEEDIERYYTHIRRGRKPEPEMLQDLKDRYEAIGGISPLAQITEQQAHNLEQHLN
   EIQDEITFKAYIGLKHIEPFIEDAVAEMHKDGITEAVSIVLAPHFSTFSVQSYNKRAKEEAEKLGGLTITSV
   ESWYDEPKFVTYWVDRVKETYASMPEDERENAMLIVSAHSLPEKIKEFGDPYPDQLHESAKLIAEGAGVSEY
   AVGWQSEGNTPDPWLGPDVQDLTRDLFEQKGYQAFVYVPVGFVADHLEVLYDNDYECKVVTDDIGASYYRPE
   MPNAKPEFIDALATVVLKKLGR
   >sp|P32396|HEMH_BACSU/1-310 Ferrochelatase OS=Bacillus subtilis (strain 168) GN=hemH PE=1 SV=1
   MSRKKMGLLVMAYGTPYKEEDIERYYTHIRRGRKPEPEMLQDLKDRYEAIGGISPLAQITEQQAHNLEQHLN
   EIQDEITFKAYIGLKHIEPFIEDAVAEMHKDGITEAVSIVLAPHFSTFSVQSYNKRAKEEAEKLGGLTITSV
   ESWYDEPKFVTYWVDRVKETYASMPEDERENAMLIVSAHSLPEKIKEFGDPYPDQLHESAKLIAEGAGVSEY
   AVGWQSEGNTPDPWLGPDVQDLTRDLFEQKGYQAFVYVPVGFVADHLEVLYDNDYECKVVTDDIGASYYRPE
   MPNAKPEFIDALATVVLKKLGR
   

   
   Последовательность в pdb отличается только отсутствием первого метионина. Все остальные остатки идентичны.

Седьмой семестр