Филогенетическое дерево

Задание 1

Отобранные бактерии

Название Мнемоника
Geobacillus kaustophilus GEOKA
Lactococcus lactis subsp. cremoris LACLM
Moorella thermoacetica MOOTA
Clostridium tetani CLOTE
Bacillus subtilis BACSU
Listeria monocytogenes serovar 1/2a LISMO
Staphylococcus aureus STAAR

Скобочная формула дерева

((LACLM, (STAAR, (LISMO, (GEOKA,BACSU)))), (MOOTA, CLOTE));

Изображение дерева

tree

Ветви дерева

Дерево содержит четыре нетривиальные ветви

1) {MOOTA, CLOTE} против {LACLM, STAAR, LISMO, GEOKA, BACSU}

2) {LACLM, MOOTA,CLOTE} против {STAAR, LISMO, GEOKA, BACSU}

3){STAAR, LACLM, MOOTA,CLOTE} против {LISMO, GEOKA, BACSU}

4){LISMO, STAAR, LACLM, MOOTA,CLOTE} против {GEOKA, BACSU}

Задание 2

С помощью таксономического сервиса NCBI можно определить, к каким таксонам относятся выбранные бактерии.

Классы Bacilli и Clostridia разделены нетривиальными ветвями {MOOTA, CLOTE} и {LACLM, STAAR, LISMO, GEOKA, BACSU}. Отряд Bacillales представлен ветвью {STAAR, LISMO, GEOKA, BACSU}, семейство Bacillaceae - {GEOKA, BACSU}. Остальные таксоны выделяют тривиальные ветви или нет информации о таксоне.

.
tree

Вернуться на главную