1. В базе данных KEGG я получила информацию о метаболическом пути 00440. Карта референсного пути изображена на Рисунке 1.
2. Из предложенных реакций я выбрала одну. Она выделена цветом на Рисунке 2.
3. В каталитическую реакцию вступают цитидинтрифосфат (ЦТФ) и 2-аминоэтилфосфонат. От ЦТФ отщепляется пирофосфат и происходит присоединение 2-аминоэтилфосфоната по фосфатной группе. Общий вид реакции:
CTP + 2-Aminoethylphosphonate <=> Diphosphate + CMP-2-aminoethylphosphonate
4. Реакцию катализирует фермент ЦТФ:этаноламин-фосфат цитидилтрансфераза (CTP:ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase).
5. Номер фермента EC 2.7.7.14. Каждое число в номере описывает функции ферменты, от более общей к частной. Первое число (2) говорит о том, что фермент относится к классу трансфераз - каталиризует перенос химических групп с одной молекулы субстрата на другую. Второе число (7) отражает подкласс: относится к ферментам, переносящим фосфор. Третье число (7) - является нуклеотидилтрансферазой. Последнее число - порядковый номер фермента среди нуклеотидилтрансфераз.
6. Я нашла данный метаболический путь у человека и лактобактерии Lactobacillus plantarum WCFS1.
Можно заметить, что не так много ферментов из метаболического пути фосфонатов и фосфинатов встретилось в данных организмах по данным KEGG. У человека встречается фермент, который я рассматривала выше. У Lactobacillus plantarum найдено 3 гена, кодирующих 3 фермента этого метаболического пути.
Для Lactobacillus plantarum в KEGG описано 979 метаболических путей, а также 3063 белок-кодирующих гена и 88 генов, кодирующих РНК.