PFAM

  1. Oписание семейства доменов

    2. Домен является эволюционно консервативным и обычно указывает на ингибиторы сериновой протеазы.

    Таблица 12-2 Информация
    AC pfam PF00050
    ID pfam Kazal-type serine protease inhibitor domain
    SEED 25
    All 16088
    SW 249
    Architectures 972
    3D 85
    Taxonomy 7k
    Eukaryota 12710
    Archaea 175
    Bacteria 2056

  2. Карта локального сходства (dotplot)

    3. Таблица 12-2 Информация
    Доменная архитектура 1 PF00050 - PF00050
    Белок с архитектурой 2 P01002
    Доменная архитектура 2 PF00050 - PF07648
    Белок с архитектурой 2 Q06684

    Рисунок 1. Карта локального сходства белков P01002 и Q06684.

    E-value 9e-17
    Первая половина выровнялась хорошо, так как у обеих архитектур эта часть совпадает(PF00050). На следующем участке можно увидеть 4 разрыва, соответствующих инделям.