PFAM

  1. Oписание семейства доменов
  2. Домен является эволюционно консервативным и обычно указывает на ингибиторы сериновой протеазы.

    Таблица 12-2 Информация
    AC pfam PF00050
    ID pfam Kazal-type serine protease inhibitor domain
    SEED 25
    All 16088
    SW 249
    Architectures 972
    3D 85
    Eukaryota 12710
    Archaea 175
    Bacteria 2056

  3. Карта локального сходства (dotplot)
  4. Таблица 12-2 Информация
    Доменная архитектура 1 PF00050 - PF00050
    Белок с архитектурой 2 P01002
    Доменная архитектура 2 PF00050 - PF07648
    Белок с архитектурой 2 Q06684

    Рисунок 1. Карта локального сходства белков P01002 и Q06684.

    E-value 9e-17
    Первая половина выровнялась хорошо, так как у обеих архитектур эта часть совпадает(PF00050). На следующем участке можно увидеть 4 разрыва, соответствующих инделям.