Белок YP_004339259.1, синтезируемый бактерией Hippea maritima

Текстовое описание:

Название белка: UDP-N-ацетилглюкозамин-карбоксивинилтрансфераза (UDP-N-acetylglucosamine1-carboxyvinyltransferase). Поскольку я не обладаю достаточными познаниями в химии белка и английском языке, во избежание недоразумений аббревиатура UDP-N оставлена без перевода.

Аминокислотная последовательность белка (открыть отдельным файлом)

Кодирующий участок генома бактерии Hippea maritima (Hipma_0223):

Иллюстрация из геномного браузера на ресурсе http://www.ncbi.nlm.nih.gov, ген трансферазы с корешами ближайшими соседями:

Сводная таблица по самому гену и его ближайшим соседям:

СвойствоСосед слеваПредметный генСосед справа
МеткаHipma_0222Hipma_0223Hipma_0224
№ начала/1000219,026219,484220,737
№ конца/1000219,484220,740221,342
Длина, баз4591257606
Расстояние между000
Рамка считывания+0+0+0

Для обсуждения, могут ли ген и оба его соседа входить в один оперон я не обладаю соответствующими познаниями в биохимии, то есть не могу определить по химическому названию белка его роль в каком-либо процессе. Ближайшие гены расположены впритык к исследуемому, скорее всего, это действительно один оперон, но утверждать это, основываясь лишь на факте расположения, я не могу.
Нуклеотидная последовательность гена: (открыть отдельным файлом)

Таблица:

Информация о белке UDP-N-ацетилглюкозамин-карбоксивинилтрансферазе из организма Hippea maritima (идентификатор белка в базе данных RefSeq пока не найден)

Вид информации Квалификатор в записи генома Значение
Локус гена в геноме /locus_tag "Hipma_0223"
Имя гена /gene 219484..220740
Идентификатор гена в базе Gene /db_xref "GeneID:10391537"
Начало гена в геноме - 219484
Конец гена в геноме - 220740
На какой цепи кодируется ген (прямая или обратная) - На прямой
Длина гена (в парах нуклеотидов) - 1257
Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein /protein_id YP_004339259.1
Длина белка (в аминокислотных остатках) - 418 (подсчитанно по позициям АК в .gbk-файле, простое деление на три числу нуклеотидов кодирующей последовательности даёт неверный с точки зрения оценки практикума №4 результат)

Аминокислотная последовательность белка: 

>YP_004339259|UDP-N-acetylglucosamine1-carboxyvinyltransferase
MDKFVIEGPAKLQGQAYISGSKNASLPMMAAAILTDEEVILSNVPKLKDIDTMCKLLIKLNCKCKRLDND
DIFINCSGINSDFAPYELVKTMRASILVFGPLLARLKSAHVSLPGGCAIGVRPVNLHIAAMKNLGADVEI
EEGYIVAKAERLEGATIYFDTPTVTGTENVLMAAALTKGKTIIKNAAKEPEVVDLAKMLKVMGAKIKGEG
ESTIEVEGVSKLRGVSYRVMSDRIEAGTFMCASLITGSTIELIDAPLYAMDAIVDKFIEVGGSIRKIDDS
RIEIKGKKIEPVVIKTAVYPGFPTDMQAQFMAVLTLANGTSVIEETIFENRFMHVAELIRLGANILISGN
KAVIEGVSHLDGATVMATDLRASASLVIAGLAAHGRTEVLRIYHLDRGYEALEKKLSSLGANIKRVKQ

Нуклеотидная последовательность гена: 

>gi|327398173|ref|NC_015318.1|:219484-220740 Hippea maritima DSM 10411 chromosome
GTGGATAAATTTGTTATAGAAGGACCAGCAAAACTTCAAGGTCAGGCTTATATAAGTGGTTCAAAGAATG
CATCCCTCCCTATGATGGCTGCAGCTATCCTGACCGATGAAGAGGTAATTTTGAGCAATGTACCTAAGCT
CAAAGATATAGATACTATGTGTAAGCTTTTGATAAAACTCAACTGTAAATGTAAGCGCCTGGATAATGAC
GATATTTTTATAAACTGTTCTGGCATAAACTCAGACTTTGCGCCTTATGAGCTTGTAAAGACAATGAGGG
CATCTATTTTGGTTTTTGGTCCACTTCTTGCCCGTCTAAAAAGTGCCCATGTATCTTTGCCGGGTGGTTG
TGCTATAGGTGTTAGGCCTGTAAACTTACACATAGCAGCTATGAAGAATTTGGGAGCTGATGTTGAAATA
GAAGAAGGATATATTGTAGCAAAAGCTGAAAGATTAGAGGGTGCAACAATCTATTTTGATACACCGACCG
TGACAGGGACTGAAAATGTCTTGATGGCCGCTGCGTTGACAAAAGGCAAGACTATAATTAAAAATGCTGC
TAAAGAGCCTGAAGTTGTAGATTTAGCAAAAATGTTGAAGGTTATGGGCGCAAAGATTAAAGGTGAAGGC
GAAAGTACCATAGAGGTTGAAGGTGTATCTAAGCTAAGAGGTGTGAGCTATAGGGTTATGAGCGATAGAA
TTGAAGCCGGGACATTTATGTGTGCGTCTTTGATTACTGGTTCGACCATAGAGCTTATTGATGCGCCTTT
GTATGCTATGGATGCCATAGTGGATAAATTTATAGAAGTTGGCGGTTCGATTAGAAAAATAGATGACTCC
AGAATTGAGATTAAGGGGAAAAAAATAGAGCCTGTAGTAATAAAAACAGCCGTATATCCTGGTTTTCCAA
CAGACATGCAGGCACAGTTTATGGCTGTTCTGACACTTGCAAATGGCACAAGTGTAATTGAGGAGACTAT
CTTTGAAAATAGATTTATGCATGTGGCTGAACTCATTAGATTGGGCGCCAATATATTGATATCTGGCAAT
AAAGCCGTTATAGAGGGTGTGAGTCATCTTGATGGGGCAACCGTTATGGCTACGGATTTAAGGGCAAGTG
CGAGTTTGGTTATAGCTGGATTGGCCGCTCATGGCAGAACAGAGGTTTTAAGGATTTATCATCTTGATAG
GGGGTATGAGGCTTTGGAGAAGAAATTGTCATCTTTGGGTGCAAATATAAAGAGGGTAAAACAATGA