| Идентификатор на дереве | Вид | Таксон |
| BRADU | Bradyrhizobium diazoefficiens | Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bradyrhizobiaceae; Bradyrhizobium |
| RHIEC | Rhizobium etli | Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Rhizobium |
| RHOS4 | Rhodobacter sphaeroides | Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Rhodobacter |
| NEIMA | Neisseria meningitidis | Proteobacteria; Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Neisseria |
| YERPE | Yersinia pestis | Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Yersinia; Yersinia pseudotuberculosis complex |
| HAEIN | Haemophilus influenzae | Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae; Haemophilus |
| PROMH | Proteus mirabilis | Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Proteus |
Помимо того, что все бактерии относятся к протеобактериям, цветом выделены совпадающие таксоны. Отметим их на рисунке из MEGA: