Практикум 14

Множественные выравнивания и Pfam

Протокол:

ID Description AC Seed Full
Paralemmin Paralemmin PF03285 21 1714

Проект Jalview можно скачать здесь.

alignment

Множественное выравнивание для семейства белков.


Блоки, выбранные в выравнивании:

Block Pattern Position
Plus-block [AEKF]E[KR]{3}.Q.E[IAVML][ED].[KR]{2}.[QE]L[DE]{2}.{5}Q[HY].KSK[AVLMT]{2}RE[RK][WLM]{3}.G 1-40
Partial plus-block EI.GV[QE]AQPGEATSG.{4}QP.QEPPVT[MLIFV]{3}.GYQNVEDE.E[TS].KVLGLQD.I.AE[LVI]{4}[EQ] 334-395
Minus-block - 88-99