Построение филогенетического дерева

Отобранные бактерии

Название	Мнемоника
Nocardioides sp.	NOCSJ
Leifsonia xyli	LEIXX
Arthrobacter sp.	ARTS2
Bifidobacterium longum	BIFLO
Corynebacterium efficiens	COREF
Corynebacterium diphtheriae	CORDI
Rubrobacter xylanophilus	RUBXD

Скобочная формула дерева

(RUBXD,((((LEIXX,ARTS2),BIFLO),NOCSJ),(COREF,CORDI)));

Изображение дерева

Ветви дерева

Дерево содержит следующие нетривиальные ветви:

{LEIXX,ARTS2} против {NOCSJ,BIFLO,COREF,CORDI,RUBXD}

{LEIXX,ARTS2,BIFLO} против {NOCSJ,COREF,CORDI,RUBXD}

{NOCSJ,LEIXX,ARTS2,BIFLO} против {COREF,CORDI,RUBXD}

{NOCSJ,LEIXX,ARTS2,BIFLO,RUBXD} против {COREF,CORDI}

Реконструкция филогении

Мнемоника	Род	Семейство	Порядок	Класс
NOCSJ	Nocardioides	Nocardioidaceae	Propionibacteriales	Actinomycetia
LEIXX	Leifsonia	Microbacteriaceae	Micrococcales	Actinomycetia
ARTS2	Arthrobacter	Micrococcaceae	Micrococcales	Actinomycetia
BIFLO	Bifidobacterium	Bifidobacteriaceae	Bifidobacteriales	Actinomycetia
COREF	Corynebacterium	Corynebacteriaceae	Corynebacteriales	Actinomycetia
CORDI	Corynebacterium	Corynebacteriaceae	Corynebacteriales	Actinomycetia
RUBXD	Rubrobacter	Rubrobacteraceae	Rubrobacterales	Actinomycetia

Из таксономических данных имеем, что все рассматриваемое дерево принадлежит классу Actinomycetia, нетривиальная ветвь {LEIXX,ARTS2} выделяет порядок Micrococcales, нетривиальная ветвь {COREF,CORDI} выделяет порядок Corynebacteriales.