J(S)mol

Практикум №1

Скачать скрипт

Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре
Имя атома Длина связи (Å) Угол N-O-C (°)
α-спирали
1 78:A.N (#617)
74:A.O (#589)
74:A.C (#588)
2.74 168
2 79:A.N (#626)
75:A.O (#596)
75:A.C (#595)
3.2 148
3 80:A.N (#634)
76:A.O (#603)
76:A.C (#602)
3.14 154
β-тяжи
1 116:B.N (#2167)
133:B.O (#2310)
133:B.C (#2308)
2.84 158
2 118:B.N (#2182)
131:B.O (#2289)
131:B.C (#2288)
3.0 145
3 120:B.N (#2200)
129:B.O (#2273)
129:B.C (#2272)
3.08 128

  1. Средняя длина водородной связи составляет ~3Å.
  2. Средняя величина угла N-O-C составляет 150° для альфа-спиралей и 156.2° для бета-тяжей
  3. Величины углов N-O-C в выборке значительно меньше 180°


© Arsenii Loginovskii, 2016
Лого ФББ