Практикум №8

Для работы был выбран домен Ribosomal_S2 (PF00318). Таксон, выбранный для составления этого профиля – Proteobacteria.

Была получена таблица Excel, по которой с помощью средств Python были построены гистограмма и график ROC-кривой.
Исходное выравнивание, полученный профиль.

Рисунок 1. Гистограмма весов всех находок (накопительная).

Рисунок 2. ROC-кривая полученного профиля.

В качестве порога было выбрано значение score = 546.5.

Полученный профиль получился высокоточным; его чувствительность составляет ~88%.

HMM-профиль