Структурные факторы — это набор величин, характеризующих способность одной элементарной ячейки кристалла когерентно рассеивать рентгеновское излучение в зависимости от числа атомов в ячейке (N), их координат (xj, уj, zj) и атомных факторов (fj).
Для выбранного мною ранее белка (AhpE, 5ID2) приведен файл структурных факторов, который я преобразовал в таблицу Excel.
Для оценки качества рентгеноструктурного эксперимента было подсчитано количество измеренных структурных факторов. Из 27811 указанных факторов измерено было 27723, остальные факторы (88) оказались пропущены (имеют статус "x").
Далее я подсчитал количество структурных факторов, имеющих силу сигнала > 3 (то есть тех, для которых среднее значение в 3 или более раз превосходит среднее квадратичное отклонение).
Таких факторов было 23650, что составило 85.3% от общего числа измеренных факторов.
При оптимизации модели учитывалось 26336 структурных факторов, что составляет 95.0% от измеренных факторов.
Также приведены примеры пропущенных структурных факторов:
№ | h | k | l | Пояснение |
1093 | 1 | 32 | 0 | Присутствуют (1; 32; 1) – (1; 32; 11) |
2426 | 3 | 31 | 0 | Присутствуют (3; 31; 1) – (3; 31; 11) |
2719 | 4 | 3 | 0 | Присутствуют (4; 3; 1) – (4; 3; 13) |
3394 | 5 | 3 | 0 | Присутствуют (5; 3; 1) – (5; 3; 13) |
4436 | 6 | 30 | 0 | Присутствуют (6; 30; 1) – (6; 30; 11) |
27267 | 53 | 28 | 0 | Присутствуют (53; 28; 1) |