Структурные факторы

Практикум №5

Терминология

Структурные факторы — это набор величин, характеризующих способность одной элементарной ячейки кристалла когерентно рассеивать рентгеновское излучение в зависимости от числа атомов в ячейке (N), их координат (xj, уj, zj) и атомных факторов (fj).

Для выбранного мною ранее белка (AhpE, 5ID2) приведен файл структурных факторов, который я преобразовал в таблицу Excel.

Анализ качества РСА по структурным факторам

Для оценки качества рентгеноструктурного эксперимента было подсчитано количество измеренных структурных факторов. Из 27811 указанных факторов измерено было 27723, остальные факторы (88) оказались пропущены (имеют статус "x").

Далее я подсчитал количество структурных факторов, имеющих силу сигнала > 3 (то есть тех, для которых среднее значение в 3 или более раз превосходит среднее квадратичное отклонение).

Таких факторов было 23650, что составило 85.3% от общего числа измеренных факторов.

При оптимизации модели учитывалось 26336 структурных факторов, что составляет 95.0% от измеренных факторов.

Также приведены примеры пропущенных структурных факторов:

h k l Пояснение
1093 1 32 0 Присутствуют (1; 32; 1) – (1; 32; 11)
2426 3 31 0 Присутствуют (3; 31; 1) – (3; 31; 11)
2719 4 3 0 Присутствуют (4; 3; 1) – (4; 3; 13)
3394 5 3 0 Присутствуют (5; 3; 1) – (5; 3; 13)
4436 6 30 0 Присутствуют (6; 30; 1) – (6; 30; 11)
27267 53 28 0 Присутствуют (53; 28; 1)

© Arsenii Loginovskii, 2016-2020
Лого ФББ