Практикум 3: обзор структуры 1SFX


Структура в целом

  1. Здесь предсталвена белковая молекула, а именно, гомодимер предполагаемого HTH регулятора транскрипции Archaeoglobus fulgidus.
  2. В структуре пристуствует две идентичные полимерные цепи (последовательность совпадает более чем на 95%). Homo 2-mer - A2.
  3. Функционально самостоятельной является одна цепь, но, судя по всему, данный транскрипционный фактор чаще существует в виде димера (или тетрамера).

Отдельные цепи

Поскольку в структуре присутствуют 2 идентичные цепи, следующая информация характеризует их обе.

  1. Данная макромолекула относится к организму Archaeoglobus fulgidus DSM 4304.
    • Uniprot_id: O28271
    • Название: Sugar-specific transcriptional regulator TrmB
    • функция: Было показано, что один член этого семейства, TrmB, является сахароспецифическим регулятором транскрипции ABC-переносчика трегалозы/мальтозы
  3. В последовательности относительно референса из Uniprot присутсвует 3 мутации.
  4. Ссылка на файл с информацией про модифицированные аминокислотные остатки (.pdb)

Малые молекулы

  1. Малые молекулы, присутсвующие в записи:
    • EDO 1,2-ETHANEDIOL
    • CL CHLORIDE ION
  2. Ссылка на файл со строчками информации о каждом типе малых молекул (.pdb)