Одна из альфа-спиралей (от 374 до 387 аминокислоты) цепи A белка:
вторичная структура стабилизируется водородными связями между остовными атомами кислорода (красные) и азота (синие), на рисунке водородные связи изображены пунктирными линиями
Правило паттерна:
пусть Cα имеет номер 1 и соеденненая с ним карбонильная группа остовной цепи тоже имеет номер 1
тогда карбонильная группа связана водородной связью с 5 аминогруппой остовной цепи
Расположение выбранной альфа-спирали (показана в шарнирной модели) в цепи A белка:
