Форма и размер белка:

По форме белок напоминает танк, и действительно:

Размеры белка: в длину: 104 Å (SER139B.CB-SER139A.CB: 104.32) в ширину: 53 Å (LYS389B.CE-ASP338A.CG: 53.01) Аппроксимируем белок сферой с диаметром - средним между длиной в ширину и в длину d=78,5 Å (1 Å=10^-10m), тогда объем белка равен

V=(4/3)*π*(d/2)³=2,53*10^-25m³

Если считать Escherichia coli цилиндром радиуса r=0,5µm и высоты h=2µm (V=π*r²*h=1,57*10^-18m³), то в клетке поместиться k=6,2*10⁶ молекул белка (но это при условии, что молекулы белка заполнят весь объем клетки, и "сферы" молекул окажуться пластичными, заполняя пространство друг между другом)
Если все 4400 белков кишечной палочки синтезированы одновременно и в равных количествах, и если их размеры равны размеру нашего белка, то каждый белок будет представлен 1409 молекулами (k/4400) (белки занимают весь объем клетки)
Современные фирмы создают кристаллы CPU с точностью до l=0,13µm, на линейке такой длины поместится 16,5 (l/d) молеклул белка PURT (т.е на линейке в 2 раза длиньше поместиться 33 молекулы)
Предел разрешения светового микроскопа оценивается как λ/2, где λ - длина волны, сколько молекул белка необходимо, чтобы увидеть их в световой микроскоп?
Смотря в каком свете их смотреть, спектр видимого света от 380 (фиолетовый) до 780 (красный) нанометров (10^-9m)
Так для фиолетого света предел разрешение равен p=190*10^-9m, необходимо 24 (p/d) молекулы белка уложенных в ряд
Для красного же света p=390*10^-9m, необходимо примерно 50 молекул
Но на практике их потребуется больше, т.к. световые микроскопы не идеальны, и теоритический предел разрешения не достигается
Однако , длинный, но бесконечно тонкий объект увидеть нельзя, ведь у линии должна быть, помимо длины, ширина. Апроксимируем молекулу квадратом со стороной d, тогда ее площадь S=d²=6.1*10^-17m²
Для фиолетового света p=190*10^-9m (для красного соответсвенно 390*10^-9m), видимый квадрат имеет площадь p²=3,6*10^-14 (1,52*10^-13), необходимое число молекул a=(p²/S)=590 (соответственно 2500)