Overlap area in Angstrom^2 between polygons defined by atoms on successive
bases. Polygons projected in the mean plane of the designed base-pair step.

Values in parentheses measure the overlap of base ring atoms only. Those
outside parentheses include exocyclic atoms on the ring. Intra- and
inter-strand overlap is designated according to the following diagram:

                    i2  3'      5' j2
                       /|\      |
                        |       |
               Strand I |       | II
                        |       |
                        |       |
                        |      \|/
                    i1  5'      3' j1

     step      i1-i2        i1-j2        j1-i2        j1-j2        sum
   1 CG/CG  0.38( 0.00)  0.00( 0.00)  3.97( 1.22)  0.62( 0.00)  4.97( 1.22)
   2 GC/GC  2.02( 0.20)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  6.45( 3.91)  8.47( 4.11)
   3 CC/GG  2.69( 0.88)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  3.40( 1.43)  6.09( 2.31)
   4 CG/CG  0.14( 0.02)  0.00( 0.00)  3.55( 0.99)  0.00( 0.00)  3.69( 1.01)
   5 GC/GC  4.09( 1.21)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  6.73( 3.73) 10.83( 4.94)
   6 CC/GG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.12( 0.00)  1.69( 1.32)  1.81( 1.32)
   7 CC/GG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  4.17( 1.70)  4.17( 1.70)
   8 CG/CG  0.10( 0.00)  0.00( 0.00)  3.72( 0.98)  0.25( 0.00)  4.07( 0.98)
   9 GG/CC  3.48( 2.13)  0.00( 0.00)  0.20( 0.00)  0.03( 0.00)  3.71( 2.13)
  10 GG/CC  4.08( 2.87)  0.00( 0.00)  0.16( 0.00)  0.00( 0.00)  4.24( 2.87)
  11 GU/AC  6.35( 3.74)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  3.96( 1.32) 10.30( 5.05)
  12 UU/GA  5.04( 2.21)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.18( 2.05) 10.22( 4.26)
  13 UU/UG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)
  14 UU/AU  1.68( 0.40)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.73( 4.40)  7.41( 4.80)
  15 UC/GA  0.73( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  4.61( 3.27)  5.35( 3.27)
  16 CU/AG  1.40( 0.33)  0.00( 0.00)  0.01( 0.00)  2.06( 1.95)  3.47( 2.28)
  17 UU/AA  0.99( 0.16)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  1.80( 1.47)  2.79( 1.63)
  18 UG/CA  0.24( 0.00)  0.00( 0.00)  3.03( 1.17)  0.00( 0.00)  3.26( 1.17)
  19 GC/GC  4.75( 1.81)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.25( 2.33) 10.00( 4.14)
  20 CG/UG  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.40( 0.14)  0.40( 0.14)
  21 GU/AU  6.26( 3.27)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.79( 4.50) 12.05( 7.77)
  22 UG/CA  0.01( 0.00)  0.00( 0.00)  3.42( 1.82)  0.00( 0.00)  3.42( 1.82)
  23 GU/UC  4.95( 1.42)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  2.16( 0.50)  7.11( 1.92)
  24 UA/UU  0.00( 0.00)  2.63( 0.28)  5.28( 3.34)  0.00( 0.00)  7.91( 3.62)
  25 AG/CU  5.53( 2.56)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  5.53( 2.56)
  26 GG/CC  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)  0.00( 0.00)