1. EnsEMBL

Поиск информации о гене человека DDAH.
Запустим BLAST/BLAT, загрузив предварительно вырезанный из записи BA0000025.embl первый экзон искомого гена (214850..215164). Перенаправимся на страницу с результатом выравнивания.
Здесь можно отметить следующие элементы:

• Окно, содержащее названия последовательности и базы данных, по которым ведется выравнивание
  
• Здесь же можно выбрать количество отображаемых находок и их сортировку
  
• Окно, отображающее месторасположение выравниваний относительно кариотипа (в виде участка на хромосоме)
  
• Окно, отображающее месторасположение выравниваний относительно последовательности в запросе (она отображена как черно-белая полоса с координатами)
  
• Окно, отображающее конечную таблицу находок и параметры отображения информации на ней: "Query (запрос)" (пункты: имя, начало, конец, наличие ориджина); параметры "Subject (находка)", "Chromosome (хромосома)", "Supercontig (суперконтиги)", "Clone (клоны)", "Lrg [Locus Reference Genomic]", "Stats (статистика)" (вес, e-value, p-value, процент идентичности, длина выранивания); "Sort By (сортировка по)" (в порядке, прямом/обратном алфавитному по именам запросов/находок/хромосомам/суперконтигам/клонам/контигам/Lrg, в порядке уменьшения/увеличения веса/e-value/p-value/процента идентичности/длины выравнивания).

Также, слева от таблицы есть ссылки для каждой находки: выравнивание [A], последовательность генома [G], просмотр контигов [C].
Перейдем по ссылке [C]. Здесь видим следующую информацию:

• Окно с изображением хромосомы и контигов, красной рамкой выделен изображенный ниже отрезок последовательности хромосомы
  
• Окно с изображением региона в побробностях: участки хромосомы (Chromosome bands), расположение контигов, расположение генов и легенда их окраски: кодирующие белки, предсказанные Ensembl/Havana, псевдогены, гены с проявленным транскриптом, РНК-гены
  
• Более детализированное интерактивное окно, отображающее к выше перечисленным данным, следующую информацию: расположение BLAST/BLAT хита относительно хромосомы, регуляторные сигналы, кДНК генов, соотношение GC-пары (%), легенда типов регуляторных сигналов
  

2. UCSC

Данный геномный браузер имеет более информативный вывод запроса и более тонкую настройку результата, нежели EnsENMBL