Киотская энциклопедия генов и геномов


1. Определение метаболических путей, в которых участвует заданный фермент   

EC: 2.3.1.16

Идентификатор KEGG - hsa:3032
hsa00062, fatty acid elongation, элонгация жирных кислот
hsa00071, fatty acid metabolism, метаболизм жирных кислот
hsa00280, valine, leucine and isoleucine degradation, деградация валина, лейцина и изолейцина
hsa01100, metabolic pathways, метаболические пути


2. Поиск в KEGG структурных формул заданных соединений   

Русское название Английское название ID Структурная формула
(S)-малат (S)-malate C00149
Пируват Pyruvate C00022

3. Поиск метаболического пути от одного заданного вещества к другому  

Выбранный путь: Citrate cycle (TCA-cycle) 
Цепочка: пируват -> (S)-малат.
Промежуточное соединение - щавелевоуксусная кислота.



4. Сравнение метаболических путей у разных организмов

Организм Цепочка реакций возможна Обоснование
(да/нет/неизвестно)
Bacillus subtilis да есть все ферменты (источник)
Archaeoglobus fulgidus да есть все ферменты (источник)
Arabidopsis thaliana да есть все ферменты (источник)
Homo sapiens да есть все ферменты (источник)

У всех всех организмов есть ферменты 6.4.1.1 и 1.1.1.37. Ниже приведено изображение TCA-cycle для человека.