Chloroflexus aggregans


Штамм: Chloroflexus aggregans DSM 9485

Синонимы: Chloroflexus aggregans MD-66

Таксономия:
домен Bacteria
раздел Chloroflexi
класс Chloroflexi
отряд Chloroflexales
семейство Chloroflexaceae
род Chloroflexus

Chloroflexus aggregans был впервые извлечен из горячих источников в Японии и был описан Ханадой и соавт.(1995). Характеристики этого вида, в основном, аналогичны другим Chloroflexus sрр. C.aggregans растет анаэробно как фотогетеротроф и аэробно как хемогетеротроф. Оптимальная температура роста C.aggregans составляет 55°С, а процент содержание пары нуклеотидов G-C в его ДНК 56,7%. Организм формирует скользящие нити переменной длины с диаметром от 1 до 1,5 мкм. Этот организм формирует в жидкой среде агрегаты, имеющие вид шаров зеленого цвета (Ханада и соавт. , 2002). Название организмов происходит от следующего наблюдения: клеточные агрегаты быстро образовывались, когда растущую культуру диспергировали до однородной суспензии. Физиологические и биохимические исследования показывают, что этот штамм отличается от штаммов Chloroflexus aurantiacus, и по этой причине были даны различные названия видов. Однако, за рамками этих начальных физиологических исследований свойства этого организма в основном неизвестны. Характеристика генома, как ожидается, внесет существенный вклад в наши знания о происхождении и эволюции фотосинтеза и поможет значительно более подробно понять бескислородный фототрофный метаболизм.

Информация взята из данных статей: Uniprot, ENA, PubMed

Интересные нямки:

Карта генома + информация о факторах транскрипции здесь

Интерактивная карта генома,сделанная на Java

Информация о аминокислотах и белках: 1. Аминокислотный состав:

Amino acid Total content Frequency
[%]
A 151239 11.22
C 11264 0.84
D 67371 5.00
E 72904 5.41
F 44991 3.34
G 102384 7.60
H 29203 2.17
I 80124 5.95
K 25489 1.89
L 151652 11.25
M 27097 2.01
N 37104 2.75
P 81093 6.02
Q 54229 4.02
R 103295 7.67
S 64393 4.78
T 82603 6.13
V 102849 7.63
W 21648 1.61
Y 36650 2.72


2.Распределение длин белков

Analysis of full-length proteins [fragments excluded]
Average protein length : 361 +/- 277 amino acid residues
Size range: 31 - 5517 amino acid residues


3. Частота кодонов в хромосомах

Наведите курсор для отображения значения