Окружение гена белка 3-dehydroquinate dehydratase в геноме бактерии Thermus thermophilus HB8
На рисунке 1 показан ген данного белка в окружении генов других белков:- RNA methyltransferase (идентификатор YP_144619.1) считавается со стороны 5'-конца рамкой +0. Расстояние до 3-dehydroquinate dehydratase 37 bp.
- DNA gyrase subunit A (идентификатор YP_144621.1) считывается со стороны 3'-конца рамкой +2. Расстояние до 3-dehydroquinate dehydratase 76 bp.
- response regulator(идентификатор YP_144618.1) считывается со стороны 5'-конца рамкой -1. Расстояние до 3-dehydroquinate dehydratase 1295 bp.
Вместе с двумя ближайшими соседями этот ген может входить в оперон. Третий самый дальний сосед не может входить в этот же оперон, потому что закодирован на обратной цепи.
Между геном этого белка и его соседом на комплиментарной цепи со стороны 5'-конца 1 ген, а между ним же и соседом со стороны 3'-конца 9.
Рисунок 1. Окружение белка 3-dehydroquinate dehydratase
в геноме бактерии Thermus thermophilus HB8 (идентификатор YP_144620.1).
Координаты демонстрируемого участка: 1292400..1295000.
Красным цветом показаны кодирующие цепи ДНК.
Рисунок получен с помощью геномного браузера сайта NCBI:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ .